自主研發!軍事醫學研究院團隊提出 MIDAS,可用于單細胞多組學數據馬賽克整合
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原標題:自主研發!軍事醫學研究院團隊提出 MIDAS,可用于單細胞多組學數據馬賽克整合
關鍵字:數據,單細胞,細胞,解讀,馬賽克
文章來源:HyperAI超神經
內容字數:8683字
內容摘要:
作者:梅菜
編輯:李寶珠,三羊
軍事醫學研究院應曉敏團隊和伯曉晨團隊,提出了一種用于單細胞多組學數據馬賽克式整合及知識遷移的計算工具 MIDAS,首次實現了通用的單細胞多組學馬賽克數據的模態對齊、數據補全、批次校正等整合功能。眾所周知,細胞是生命體的最小組成單位,人體內含有 40-60 萬億個細胞,構成了我們生長、發育的基礎,在單細胞層面開展研究對于精確理解細胞的生長發育以及疾病的診斷與治療至關重要。
近年來,單細胞測序技術異軍突起,成為分子生物學研究的熱點,業界圍繞疾病、發育等臨床和基礎研究問題,已經產生了大量的單細胞測序數據。然而,來源于不同組學組合、不同測序技術、不同測序樣本的海量數據就像地板上的馬賽克瓷磚一樣分散、多樣。如何整合如此龐大、雜亂的數據并開展生物醫學研究,是全球科學家共同面臨的難題。
為了攻克這一挑戰,近期,軍事醫學研究院應曉敏團隊和伯曉晨團隊在 Nature Biotechnology 期刊發表了題為「Mosaic integration and knowledge transfer of single-cell multimodal data with MIDA
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