命中率達(dá)60%,AlphaFold預(yù)測(cè)受體的三維結(jié)構(gòu),加速藥物開(kāi)發(fā)

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原標(biāo)題:命中率達(dá)60%,AlphaFold預(yù)測(cè)受體的三維結(jié)構(gòu),加速藥物開(kāi)發(fā)
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人工智能正在徹底改變蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),為藥物設(shè)計(jì)提供前所未有的機(jī)遇。
為了評(píng)估對(duì)配體發(fā)現(xiàn)的潛在影響,瑞典烏普薩拉大學(xué)(Uppsala University)和瑞典卡羅林斯卡學(xué)院(Karolinska Institute)的研究人員利用人工智能創(chuàng)建了一種受體的未知三維結(jié)構(gòu)模型。
在這個(gè)模型中,TAAR1 受體是一種重要的靶蛋白,可用于開(kāi)發(fā)治療精神疾病的藥物。激活 TAAR1 的藥物分子在治療精神癥和抑郁癥方面顯示出良好的效果。
該團(tuán)隊(duì)比較了使用 AlphaFold 機(jī)器學(xué)習(xí)方法生成的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和傳統(tǒng)同源性建模的虛擬篩選。
研究人員用超過(guò) 1600 萬(wàn)種化合物對(duì)接到 TAAR1 模型上,分別從 AlphaFold 和同源性模型篩選中篩選出 30 和 32 種排名靠前的化合物。其中 25 種是 TAAR1 激動(dòng)劑,藥效范圍為 12 至 0.03 μM。
AlphaFold 篩選的命中率(60%)比同源模型高出兩倍多,并且發(fā)現(xiàn)了最有效的激動(dòng)劑。
其中一種具有良好選擇性和類(lèi)藥物特性的 TAAR1 激動(dòng)劑,在野生型小鼠中表現(xiàn)出生理和抗精神病作用。
該研究以
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