全方位突破:從抗體優化到基因編輯工具。

蛋白質設計的創新突破:EVOLVEpro平臺
近年來,科學家們在蛋白質設計領域取得了顯著進展,人工智能(AI)技術的應用將這一領域推向了新的高度。來自哈佛醫學院、麻省理工學院等機構的研究團隊開發了名為EVOLVEpro的人工智能平臺,為定向蛋白質進化提供了全新的解決方案。
1. EVOLVEpro平臺的核心優勢
EVOLVEpro基于少樣本主動學習框架,結合蛋白質語言模型(PLMs)和回歸模型,能夠僅依靠蛋白質序列進行優化,而無需依賴結構信息或專家經驗。這一創新使得高活性蛋白突變體的預測和設計更加高效,性能提升可達100倍。
2. 跨領域應用的潛力
該平臺在RNA生產、基因編輯及抗體結合等多個領域展現出優越性能。研究表明,EVOLVEpro能夠顯著提高基因編輯工具的活性,并改善抗體的結合能力和表達水平。此外,在新型脂質納米顆粒的優化實驗中,EVOLVEpro幾乎完全消除了脫靶效應,為精準醫療奠定了基礎。
3. 傳統技術的局限性
傳統的蛋白質優化技術如深度突變掃描(DMS)和定向進化往往面臨耗時費力的問題,容易陷入局部最優解。而基因編輯技術如CRISPR-Cas9也存在精準性不足和遞送效率低的問題。
4. EVOLVEpro的性能驗證
研究團隊通過對多個數據集的優化,驗證了EVOLVEpro在抗體和基因編輯工具上的表現。C143抗體的結合親和力和微型CRISPR核酸酶的插入缺失效率均顯著提升,證明了EVOLVEpro的有效性。
5. 未來的挑戰與展望
盡管EVOLVEpro展示了巨大的潛力,但仍面臨一些挑戰,如蛋白質語言模型的局限性和活性景觀的復雜性。研究人員計劃進一步優化EVOLVEpro模型,探索其在更多生物醫學領域的應用,以滿足對高性能蛋白質的需求。
總之,EVOLVEpro的問世為蛋白質優化與基因編輯工具的研發開辟了新視角,隨著技術的持續進步,未來在生命科學領域可能會迎來更多的突破,為癌癥治療與新藥研發提供新的可能性。
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文章來源:大數據文摘
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