輕松上手分子動力學模擬器LAMMPS：npt控溫估計FCC Cu熔點

無需安裝軟件，CPU 即可運行

原標題：輕松上手分子動力學模擬器LAMMPS：npt控溫估計FCC Cu熔點
文章來源：HyperAI超神經
內容字數：2672字

HyperAI超神經官網推出LAMMPS入門教程

HyperAI超神經官網的教程板塊上線了新的LAMMPS入門教程：「LAMMPS入門教程：npt控溫估計FCC Cu熔點」。該教程旨在幫助用戶快速上手LAMMPS，一款功能強大的分子動力學模擬軟件。

LAMMPS軟件介紹

1. LAMMPS (Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是由美國Sandia國家實驗室開發的開源軟件，自2004年發布以來，在材料建模領域得到了廣泛應用。

2. 它可用于模擬多種材料，包括固態材料（金屬、半導體）、生物分子和聚合物等，并提供多種粒子相互作用模型。

3. LAMMPS支持單處理器和并行運行，代碼設計易于修改和擴展，并在CPU、GPU和Intel Xeon Phis上提供加速性能。

4. 從2004年的5萬行代碼發展到2022年的100萬行代碼，展現了其持續的改進和功能擴展。

教程內容及運行步驟

1. **教程目標:** 理解npt控溫操作流程，學習使用dump和fix指令進行數據預處理。

2. **在線運行:** 用戶可在HyperAI超神經官網教程頁面找到該教程，并點擊“在線運行此教程”進行體驗。需要注冊HyperAI賬號，新用戶可使用提供的邀請鏈接獲取免費時長。

3. **運行環境:** 教程使用CPU版本的LAMMPS，并提供NVIDIA RTX 4090算力選擇（需付費）。

4. **運行步驟:** 克隆教程到個人容器，選擇算力及付費方式，等待資源分配。進入工作空間后，解壓提供的壓縮包`melt_u3.zip`，包含預設的LAMMPS輸入文件。在終端運行命令`mpirun -np 2 lmp < melt.in | tee out`運行模擬（約5-10分鐘）。

數據處理與可視化

1. **數據獲取:** 模擬完成后，`t_v.txt`文件包含溫度體積數據，`md.lammpstrj`文件包含原子軌跡數據。

2. **軟件安裝:** 教程指導用戶使用`apt-get`更新apt源并安裝`gnuplot`繪圖工具。

3. **結果可視化:** 運行`gnuplot p.plt`腳本生成溫度-體積曲線圖，確定熔點（約1600K）。

4. **原子軌跡可視化:** 將`md.lammpstrj`文件下載到本地，使用OVITO軟件打開并播放，觀察銅原子溶解過程。

教程交流群

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