Flowjo

Flowjo官網(wǎng)

Flowjo，流式細(xì)胞數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)可視化
網(wǎng)站服務(wù)：Flowjo，別摸魚導(dǎo)航。

Flowjo官網(wǎng)，數(shù)據(jù)可視化，流式細(xì)胞數(shù)據(jù)

Flowjo是什么

FlowJo 是一款流式細(xì)胞儀數(shù)據(jù)分析軟件，它被廣泛用于對流式細(xì)胞儀生成的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理、可視化和解釋。FlowJo 的主要功能包括數(shù)據(jù)清洗、流程分析、數(shù)據(jù)可視化、種群比較和統(tǒng)計分析等。用戶可以通過 FlowJo 對細(xì)胞表型、功能和亞群進(jìn)行分析，并生成高質(zhì)量的圖形和報告。FlowJo 提供了強大的數(shù)據(jù)分析工具、多種圖表和圖像選項、自定義的數(shù)據(jù)篩選和控制、高級統(tǒng)計方法等功能。同時，F(xiàn)lowJo 還支持插件擴展，以滿足不同用戶的需求。該軟件在生命科學(xué)研究領(lǐng)域，特別是免疫學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)和臨床研究中得到了廣泛應(yīng)用。FlowJo 不僅適用于單個樣本的數(shù)據(jù)分析，還能處理多重樣本、復(fù)雜的實驗設(shè)計和大規(guī)模數(shù)據(jù)集。它提供了直觀友好的界面，使用戶能夠方便地導(dǎo)入、管理和分析流式細(xì)胞儀數(shù)據(jù)。需要注意的是，F(xiàn)lowJo 是一個商業(yè)軟件，用戶需要購買許可證才能使用其完整功能。
Flowjo官網(wǎng)：https://www.flowjo.com/

Flowjo單熒光流式結(jié)果分析與作圖

1.首先打開FlowJo軟件，并將流式結(jié)果拉進(jìn)打開的對話框（p2）
2.選中結(jié)果雙擊，對其進(jìn)行坐標(biāo)參數(shù)設(shè)置（p3）
3.點擊T還可以對坐標(biāo)數(shù)值進(jìn)行調(diào)節(jié)（p4）
4.以空白組為基準(zhǔn)設(shè)置線型門（p5）
5加入layout editor進(jìn)行作圖（p6）
6.剛加入時每組會在同一位置，將他們分開查看，要做疊加圖的話，就可以再把它們拽到第一組上層，出現(xiàn)藍(lán)框后，松開就可以疊加（p6）
7.圖片的疊加形式可以通過右鍵點擊圖片來進(jìn)行選擇（p7）
8.獲得四種不同形式圖（p8）

Flowjo分析細(xì)胞周期

細(xì)胞周期是指以有絲方式增殖的細(xì)胞從親代結(jié)束到子細(xì)胞結(jié)束所經(jīng)歷的過程。通常由G0/G1期、S期、G2期和M期組成。G1期：細(xì)胞開始RNA和蛋白質(zhì)的合成，但DNA含量仍保持二倍體。S期：DNA開始合成，這時細(xì)胞核內(nèi)DNA的含量介于G1期和G2期之間。當(dāng)DNA復(fù)制結(jié)束成為4倍體時，細(xì)胞進(jìn)入G2期。G2期的細(xì)胞繼續(xù)合成RNA及蛋白質(zhì)，直到進(jìn)入M期。因此，單純從DNA含量無法區(qū)分G2期和M期。一旦有絲發(fā)生，細(xì)胞成兩個細(xì)胞，這兩個細(xì)胞或者進(jìn)入下一個細(xì)胞周期，或者進(jìn)入靜止期（G0期），而G0期從DNA含量上同樣無法與G1期區(qū)分。因此，整個復(fù)制周期可以描述為G0/G1、S、G2/M期。通過核酸染料PI標(biāo)記DNA，并由流式細(xì)胞儀進(jìn)行分析，可以得到細(xì)胞各個時期的分布狀態(tài)，計算出G0/G1%、S%、G2/M%，了解增殖能力，在腫瘤病理學(xué)研究中，通常以S期細(xì)胞比率作為判斷腫瘤增殖狀態(tài)的指標(biāo)。
細(xì)胞周期檢測的原理：
核酸染料可以與DNA分子特異性的結(jié)合，細(xì)胞周期檢測中PI最為常用。PI為插入性核酸熒光染料，能選擇性的嵌入核酸DNA和RNA雙鏈螺旋的堿基之間與之結(jié)合，其結(jié)合的量與DNA的含量成正比例關(guān)系，用流式細(xì)胞儀進(jìn)行分析，就可以得到細(xì)胞周
FlowJo分析細(xì)胞周期教程
首先在我們的電腦上安裝FlowJo X（需要安裝軟件請關(guān)注微信號，留言回復(fù)“軟件”索取）
打開上圖的第二個圖標(biāo)，直接拖入需要分析的流式周期fcs文件
雙擊打開要分析的文件，會出現(xiàn)以下界面。X軸選擇FSC-A，Y軸選擇SSC-A。請注意標(biāo)紅框的位置要選擇Linear Axis。
在文件左上區(qū)域根據(jù)習(xí)慣選擇一種圈門方式，圈出符合分析條件的細(xì)胞團(tuán)
雙擊細(xì)胞團(tuán)，進(jìn)入一個新的界面。用方框的門圈出single cells。
返回主界面，右鍵single cells，選擇cell cycle。
出現(xiàn)如下界面，單擊OK。
進(jìn)入結(jié)果分析界面，選擇通道PE-A
然后就得到了彩色的周期圖。
返回主界面，選擇如下圖標(biāo)，將cell cycle直接拖入右邊對話框，再儲存成我們需要的文件格式。
如果需要批量分析的話，可以選中如下文件，直接鼠標(biāo)拖入下一個文件中。導(dǎo)出文件時，也可以批量導(dǎo)出。

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