Flowjo官網
Flowjo,流式細胞數據,數據可視化
網站服務:Flowjo,別摸魚導航。
Flowjo官網,數據可視化,流式細胞數據
Flowjo是什么
FlowJo 是一款流式細胞儀數據分析軟件,它被廣泛用于對流式細胞儀生成的數據進行處理、可視化和解釋。FlowJo 的主要功能包括數據清洗、流程分析、數據可視化、種群比較和統計分析等。用戶可以通過 FlowJo 對細胞表型、功能和亞群進行分析,并生成高質量的圖形和報告。FlowJo 提供了強大的數據分析工具、多種圖表和圖像選項、自定義的數據篩選和控制、高級統計方法等功能。同時,FlowJo 還支持插件擴展,以滿足不同用戶的需求。該軟件在生命科學研究領域,特別是免疫學、細胞生物學和臨床研究中得到了廣泛應用。FlowJo 不僅適用于單個樣本的數據分析,還能處理多重樣本、復雜的實驗設計和大規模數據集。它提供了直觀友好的界面,使用戶能夠方便地導入、管理和分析流式細胞儀數據。需要注意的是,FlowJo 是一個商業軟件,用戶需要購買許可證才能使用其完整功能。
Flowjo官網:https://www.flowjo.com/
Flowjo單熒光流式結果分析與作圖
1.首先打開FlowJo軟件,并將流式結果拉進打開的對話框(p2)
2.選中結果雙擊,對其進行坐標參數設置(p3)
3.點擊T還可以對坐標數值進行調節(p4)
4.以空白組為基準設置線型門(p5)
5加入layout editor進行作圖(p6)
6.剛加入時每組會在同一位置,將他們分開查看,要做疊加圖的話,就可以再把它們拽到第一組上層,出現藍框后,松開就可以疊加(p6)
7.圖片的疊加形式可以通過右鍵點擊圖片來進行選擇(p7)
8.獲得四種不同形式圖(p8)
Flowjo分析細胞周期
細胞周期是指以有絲方式增殖的細胞從親代結束到子細胞結束所經歷的過程。通常由G0/G1期、S期、G2期和M期組成。G1期:細胞開始RNA和蛋白質的合成,但DNA含量仍保持二倍體。S期:DNA開始合成,這時細胞核內DNA的含量介于G1期和G2期之間。當DNA復制結束成為4倍體時,細胞進入G2期。G2期的細胞繼續合成RNA及蛋白質,直到進入M期。因此,單純從DNA含量無法區分G2期和M期。一旦有絲發生,細胞成兩個細胞,這兩個細胞或者進入下一個細胞周期,或者進入靜止期(G0期),而G0期從DNA含量上同樣無法與G1期區分。因此,整個復制周期可以描述為G0/G1、S、G2/M期。通過核酸染料PI標記DNA,并由流式細胞儀進行分析,可以得到細胞各個時期的分布狀態,計算出G0/G1%、S%、G2/M%,了解增殖能力,在腫瘤病理學研究中,通常以S期細胞比率作為判斷腫瘤增殖狀態的指標。
細胞周期檢測的原理:
核酸染料可以與DNA分子特異性的結合,細胞周期檢測中PI最為常用。PI為插入性核酸熒光染料,能選擇性的嵌入核酸DNA和RNA雙鏈螺旋的堿基之間與之結合,其結合的量與DNA的含量成正比例關系,用流式細胞儀進行分析,就可以得到細胞周
FlowJo分析細胞周期教程
首先在我們的電腦上安裝FlowJo X(需要安裝軟件請關注微信號,留言回復“軟件”索取)
打開上圖的第二個圖標,直接拖入需要分析的流式周期fcs文件
雙擊打開要分析的文件,會出現以下界面。X軸選擇FSC-A,Y軸選擇SSC-A。請注意標紅框的位置要選擇Linear Axis。
在文件左上區域根據習慣選擇一種圈門方式,圈出符合分析條件的細胞團
雙擊細胞團,進入一個新的界面。用方框的門圈出single cells。
返回主界面,右鍵single cells,選擇cell cycle。
出現如下界面,單擊OK。
進入結果分析界面,選擇通道PE-A
然后就得到了彩色的周期圖。
返回主界面,選擇如下圖標,將cell cycle直接拖入右邊對話框,再儲存成我們需要的文件格式。
如果需要批量分析的話,可以選中如下文件,直接鼠標拖入下一個文件中。導出文件時,也可以批量導出。
Flowjo網址入口
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數據統計
數據評估
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