ReadPaper是粵港澳區數字經濟研究院推出的專業論文閱讀平臺和學術交流社區,收錄近2億篇論文、近2.7億位科研論文作者、近3萬所高校及研究機構,包括nature、science、cell、pnas、pubmed、arxiv、acl、cvpr等知名期刊會議,涵蓋了數學、物理、化學、材料、金融、計算機科學、心理、生物醫學等全部已知學科,打造專業的學術討論社區。科研工作離不開論文的幫助,如何讀懂論文,讀好論文,這本身就是一個很大的命題,我們的使命是:“讓天下沒有難讀的論文”。
至于要說為什么的話,終于有一款軟件站出來嘗試打通學術知識的搜索-管理-閱讀-分享
過程了,并且,還是一款國人的軟件。
這款軟件,正如官方介紹的那樣:
Readpaper 是一個新上線的免費學術社區,旨在為科研工作者提供好用的科研工具以及交流平臺,功能包括論文搜索、文獻管理、在線筆記與學術討論。每篇論文都應該有自己的社區,科研不易,ReadPaper希望為一代代科研人鋪設進階之路。

下面我們就來了解一下吧。
1-搜索
比如我想搜索這篇文章:
Multi-Omics Immuno-Oncology Biological Research to Decode Tumor Microenvironment and Signatures
返回的搜索結果非常的小清新:

這里顯示有pdf 的搜索結果,就表示文章在readpaper數據庫是有收錄的。我們可以直接閱讀。
這里我有些好奇他們的文章獲取來源:
每天更新Arxiv最新論文 豐富的論文相關信息(引用/被引用情況、引用格式、doi信息、會議期刊信息……)
可惜僅僅只是預印本上的內容。
比如這篇Frontiers in Oncology 上的文章:?Multi-omics profiling of the tumor microenvironment: Paving the way to precision immuno-oncology (http://readpaper.com)[3]
就沒法獲取了。
這里我覺得可以模仿一下Welcome to Unpaywall | Unpaywall[4]: 用于獲取全文公開的數據庫中的文章,也應該沒有版權方面的問題。

對于readpaper 沒有收錄的論文,你可以選擇手動上傳:

2-管理
在搜索結果中,我們可以直接將感興趣的文章直接收藏并添加標簽的:

除此之外,還可以點擊個人頭像:

進行二次標簽管理,以及備注說明:

ps:這個備注展開顯示很贊。
以及批量的文獻處理:

我們可以點擊論文集模式
進入類似文件夾操作的界面,

從而查看不同分類下的文章:

另外,當我們需要刪除整個標簽時,移除的僅僅只是標簽,論文并不會因此受到影響。
ps:文章是可以貼上不同的標簽的。
你可能發現上面的小組按鈕了,這里我們先按下不表。
3-閱讀
在B站的宣傳視頻里,最吸引我眼球的就是這個閱讀了。
這里我們直接點擊需要閱讀的文獻:

就會進入閱讀界面了:

這里我們從右到左開始介紹
。
3.1-功能菜單

通常我們在閱讀文章的時候,如果是直接pdf 閱讀,想要查看參考文獻與文章被引非常的麻煩。
- 比如參考文獻,我一般的策略是打開兩個pdf,一個直接拉到最后的Reference,再把感興趣的引用文章名稱復制到谷歌學術。非常麻煩。
- 而被引,則更加不方便,一般還得使用web of science 這種專業的搜索引擎才能解決。
這里可以直接點擊相關的文章,可以直接跳轉到相關的readpaper界面:

這里我建議官方增加跳轉到論文所在發表期刊的網頁鏈接,畢竟發表在預印本上的文章并不是占多數,尤其是醫學與生命科學的領域。
其實這里的鏈接在readpaper 并沒有收錄文章的情況下略顯雞肋,真正精彩的還在正文的閱讀中。
其他部分還包括筆記與問答。
筆記部分記錄了在正文中劃線句所在的頁面、劃線句所在的位置、劃線段落添加的筆記:

令人驚喜的是,這里的筆記是支持md 語法的,當你編輯完畢后,點擊頁面其他位置:

只不過目前的顏色并沒有很好的適配:

當你點擊筆記的時候,炫酷的一幕就發生了,可是實現筆記與文章段落的定位:

媽媽再也不用擔心我找不到筆記的位置了。
此外還添加了問答的界面:

你可以在這里查看其他用戶關于這篇文章的討論。
此外,在文章所在的主頁,也有專門的筆記與問答收錄界面:

除此之外,功能菜單中也有圖標提取的選項,對應上面主頁中的內容:

只不過,功能菜單中添加了關于figure 的描述文字,可以方便我們快速定位,以及將圖片復制到ppt 或筆記中用于總結或是分享。
3.2-主閱讀界面
這里直接參考:幫助文檔-論文閱讀(BETA)-專業的學術討論社區-粵港澳區數字經濟研究院(福田) (http://readpaper.com)[5]
readpaper 的功能主要分成兩個部分:滑動操作與底部操作選項欄。
3.2.1-滑動操作
readpaper 提供了滑動操作的功能:

跳出來的操作選項分別為:
- 中英翻譯
- 設置筆記顏色
- 添加筆記
滑動即所得的翻譯:

通過設置不同的筆記顏色,我們還可以分配不同的筆記類型,比如藍色對應方法,紅色對應展望等等,后期按照顏色設計規則進行選擇:

3.2.2-底部操作欄
幾個按鈕的功能依次是:

- 全屏模式
- 隱藏全文標記
- 撤回、重做
- 截圖
- 全文查找
這里我想主要提一下全文查找。
不同于一般的pdf 檢索,readpaper 會將全部匹配結果的上下文顯示在功能菜單中:

并且標記出對應匹配結果所在的頁面,當你點擊相應搜索結果后會實現內容的跳轉。
3.2.3-增強效果的pdf閱讀器
這里的引用標簽并沒有被我手動高亮出來:

實際上,這是readpaper 自動識別的,當你鼠標點擊對應引文的時候,精彩的就來了:

通過閱讀該篇引文的摘要,你可以直接收藏該文章并添加相關的標簽,你也可以點擊標題進入相應文章的readpaper 界面。
還記得我開頭說的困境嗎?
- 比如參考文獻,我一般的策略是打開兩個pdf,一個直接拉到最后的Reference,再把感興趣的引用文章名稱復制到谷歌學術。非常麻煩。
直接結合上下文以及這篇引文的摘要,直接一鍵搞定全部。
此外,當我們的鼠標滑動至高亮內容(筆記)的相關段落上方時,會自動跳出在該段落進行的記錄。

3.3-預覽菜單
左側的預覽菜單就比較常規了:

可以調整菜單模式與預覽模式,如果覺得顯示不全,可以通過拖拽連接部分,調整大小;或是上方紅色箭頭,將該菜單收起。
點擊菜單中的內容,會跳轉到相應位置,并高亮該標題的結果:

3.4-調整視窗
當你的鼠標停留在閱讀界面的三個主要部分的連接部分時,是可以對其進行拖拽,調整大小:


3.5-論文速讀
這里我們再回到文章的主頁:IOBR: Multi-omics Immuno-Oncology Biological Research to decode tumor microenvironment and signatures (http://readpaper.com)[6]
往下拉拽,會發現readpaper 設計了一個論文速讀的界面:

包括十個內容:
Q1 論文試圖解決什么問題? Q2 這是否是一個新的問題? Q3 這篇文章要驗證一個什么科學假設? Q4 有哪些相關研究?如何歸類?誰是這一課題在領域內值得關注的研究員? Q5 論文中提到的解決方案之關鍵是什么? Q6 論文中的實驗是如何設計的? Q7 用于定量評估的數據集是什么?代碼有沒有開源? Q8 論文中的實驗及結果有沒有很好地支持需要驗證的科學假設? Q9 這篇論文到底有什么貢獻? Q10 下一步呢?有什么工作可以繼續深入
打開回答頁面后,除了上面的十答以外,還有摘要的翻譯任務:

不過這里我發現readpaper 是沒有設置審核機制的,這也就意味著你填寫的任何信息提交后都可以顯示給其他全體用戶:

數據統計
數據評估
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