計算機學院是在1980年設立的本科計算機專業的基礎上發展起來的。1980年9月開始面向全國招收了第一批計算機應用專業本科生，1981年開始招收計算機應用技術碩士研究生。1984年5月設立的電子計算機系。2000年7月，為適應信息學科快速發展的需要，成立計算機學院。2001年7月，經浙江省教育廳批準，以計算機學院為依托，成立浙江省省屬高校第一家軟件學院。2002年7月軟件學院建制。2004年10月，計算機學院與軟件學院合并，組成新的計算機學院。2009年12月，學校決定在軟件學院的基礎上成立軟件工程學院。2015年3月11日，撤銷計算機學院、軟件工程學院，成立新的計算機學院。同時成立軟件學院，計算機學院和軟件學院合署辦學，實行“一套班子、兩塊牌子”。
1993年獲得計算機應用技術碩士學位授予權，1998年獲得計算機軟件與理論碩士學位授予權，2003年學院獲得計算機技術、軟件工程兩個領域的工程碩士學位授予權，2005年獲得計算機科學與技術一級學科碩士學位授予權和二級學科計算機系統結構碩士學位授予權。2000年計算機應用技術成為省重點學科，計算機軟件與理論成為原信息產業部重點學科，2004年計算機科學與工程成為浙江省重點學科（A類）。2008年計算機應用技術成為浙江省高校重中之重學科，2009年獲得計算機科學與技術一級學科博士學位授予權立項建設。2011年8月經國務院學位委員會批準，軟件工程獲得一級學科碩士學位授予權。2012年1月依托一級學科計算機科學與技術增設兩個目錄外二級學科：物聯網技術、數字媒體技術（2013年開始招生）2013年7月成為浙江省屬高校中唯一的計算機科學與技術博士學位授權一級學科點，并于2014年招收博士生；2016年1月被浙江省遴選為“十三五”首批一流學科（A類）。2019年9月，人力資源社會保障部、全國博士后管理委員會聯合下文“計算機科學與技術”一級學科獲批設立博士后科研流動站。2017年12月，教育部學位與研究生教育發展中心公布全國第四輪學科評估結果，計算機科學與技術學科在全國第四輪學科評估中獲B+（前10%-20%），在浙江省屬高校中排名第一。2017中國科學評價研究中心最新學科排名，計算機學科在全國281個同類學科中排名24位，進入全國計算機學科前10%。2018年5月，計算機科學學科排名實現歷史突破，首次進入ESI全球排名前1%，在進入全球前1%的409個研究機構中排名第369位，在大陸高校中排名第45位。
目前學院擁有計算機科學與技術（1980年）、軟件工程（2003年）二個本科專業，其中“計算機科學與技術”是國家特色建設專業、國家管理專業、國家工程教育認證專業（2015.1—2023.12）、教育部“本科教學工程”地方高校第一批綜合改革試點專業、浙江省本科院校“十二五”優勢專業、浙江省本科院校“十三五”優勢專業建設項目；“軟件工程”是國家級卓越工程師教育培養計劃專業、國家級高等學校特色專業建設點專業、國家工程教育認證專業（2019.1——2024.12）、浙江省培養服務外包人才試點專業、浙江省普通高校重點專業、浙江省本科院校“十三五”優勢專業建設項目。
學院擁有一支結構合理、具有較高學術水平與研究能力的學科梯隊，現有教職工180余人，專任教師150余人，其中博士生導師23人、教授35人(其**聘教授4人)、副教授57人、具有博士學位教師127人。學院擁有共享院士1人，國家千*1人，國家杰青1人，國家優青1人，教育部國家青年**1人，教育部“新世紀優秀人才支持計劃”2人，國家百千萬人才1人，浙江省“萬*計劃”科技創新領軍人才3人，浙江省“萬*計劃”青年拔尖人才2人，浙江省高等學校“錢江高級人才”（特聘教授）2人，浙江省中青年突出貢獻專家1人，浙江省“151人才工程”一層次3人，二層次2人,三層次15人，浙江省中青年學科帶頭人9人，浙江省教學名師1人、浙江省優秀教育工作者1人。現有在讀本科生2000余人，研究生790余人。