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BioRxiv簡介
《BioRxiv》是美國的一個非營利組織Cold Spring Harbor Laboratory于2013年創建的學術論文存儲和發布平臺,也被稱為預印本在線期刊。預印本是指科研人員在正式出版之前,自愿將研究成果發布在學術會議或互聯網上,以便進行同行交流。與傳統在線學術期刊相比,預印本具有類似的特點,如公開發表、標準格式和自動獲取等,但最顯著的區別是無需同行評審。
BioRxiv官網: https://www.biorxiv.org/
BioRxiv怎么樣?
由于無需同行評審,投稿至《BioRxiv》的周期較短,只需通過基本篩查,如非剽竊抄襲、科學性和非攻擊性等即可發表。嚴格來說,《BioRxiv》并非一本雜志,因此沒有影響因子。
優勢
《BioRxiv》相對于傳統期刊的優勢有哪些?
為何要將手稿投至《BioRxiv》?首先,可以盡早發表研究成果,避免同行較早發表相似研究成果而打亂發表計劃。《BioRxiv》具有高效的時間管理,48小時內即可顯示,作為先后順序的證據。其次,《BioRxiv》發表論文是免費的。此外,與傳統論文一樣,可通過DOI和PMID進行檢索和引用。自《BioRxiv》成立以來,越來越多的醫學期刊加入合作,包括《科學》、《自然》和《柳葉刀》等。預計未來將有更多期刊與《BioRxiv》合作。
手稿可在提交其他期刊之前或評審階段發布在《BioRxiv》上,但如果已被其他期刊接受,則不應再發表于《BioRxiv》上。在正式接受文章之前,作者可隨時提交修訂版本。一旦手稿提交至《BioRxiv》,作者可收到同行的反饋意見。
當然,第一時間將研究成果發布至《BioRxiv》也存在缺點,若后續投稿不順利,很容易被他人的最新成果覆蓋甚至抄襲。
因此,是否使用《BioRxiv》發布文章需要作者自行權衡利弊。然而,個人認為基礎研究周期較長,很少存在被抄襲的情況。而且,對學術不端行為進行了嚴格查處,一旦確認,相關科研人員將承受巨大的代價。
在生物學領域,文章即你的通行證。然而,文章的發表是一個耗時耗力耗心血的過程,從投稿—送審—收到修改意見—修回—接收,少說也得有3-5個月,這還是在一次性成功的情況下。更常見的是多次修回的,拒稿重投的,耗上個一年半載甚至數年也是常事(Nature論文修回的時間不限,修個兩三年也是很常見的事情)。當你急需文章需要畢業或者申請職位或基金時,一個不需要同行評審的預印本發行和存儲服務—BioRxiv(發音為bio-archive)或許能幫助你,并且該服務是免費的。
BioRxiv測評
首先簡單介紹一下BioRxiv: 它由非營利的研究和教育機構冷泉港實驗室在2013年發起并運維,將其作為一種促進學術交流的方法,目前只接收英文手稿。由于不需要同行評審,所以耗時短。只要你的文章通過了攻擊性和/或非科學性、剽竊抄襲等基本篩查即可發表。BioRxiv不是雜志,所以沒有影響因子。當你將手稿提交到BioRxiv后,你可以收到同行的反饋意見。手稿可以在提交雜志之前或雜志評審階段發布在BioRxiv上,但如果已被雜志接收,則不應發布。在期刊正式接受文章之前,作者可以隨時通過點擊作者區域內的“提交修訂”來提交文章的修訂版本。一旦發布到biorxiv上,文章就可以引用,因此無法刪除。
BioRxiv有如下幾點優勢:1)可以盡早地公開自己的發現,當你的手稿在線發表在BioRxiv后,BioRxiv會顯示發表時間,這可以避免以下尷尬:在這漫長的投稿-發表過程中,你的競爭者捷足先登,在雜志上發表了和你類似的發現,這可能會打亂你原來的發表計劃,轉投其他雜志,或者再補充新的數據超越前者。而BioRxiv因為其時效快,48小時內即可顯示,可以作為先后順序的證據,或引導你和競爭者背靠背發表。2)發表在BioRxiv上的文章也可以作為申請基金或者崗位的籌碼,大多數研究資助者開始將預印本“合法化”。目前,英國醫學研究理事會、NIH以及霍華德·休斯醫學研究所都鼓勵受資助者在基金申請書中引用預印本,而不只是經過同行評議的論文。陳和扎克伯格基金會(CZI)甚至要求受資助者在論文被提交給期刊的同時發表預印本。
作為當下生物領域最大的預印本發行服務,BioRxiv的流行度如何呢?哪個專業的文章發表最多呢?發表在BioRxiv上的文章最終發表在哪些雜志上了?這些文章的引用率和下載量如何呢?明尼蘇達大學的Ran Blekhman 和Richard J.Abdill就這些問題對2013-2018年11月的37,648篇文章進行了數據分析,他們發現發表在BioRxiv的文章量呈逐年逐月遞增趨勢(圖1a),下載量也成遞增趨勢(圖1b),同時選擇發表在BioRxiv的作者數目也在增加(圖1c)。其中2018年投稿數目為18,825,比之前四年的總合還多,這里面神經科學和生物信息學方向的文章數目和比重最高,分占一二席。單2018年10月就有2,000投稿量。下載量方面,單篇文章的下載量中位數是279,其中基因組學的單篇下載量中位數最高,為496,但由于神經科學文章量最多,使其在下載總量方面于2018年10月首次超過生物信息學。目前已有十萬六千多作者在BioRxiv上投稿,2018年新增了84,000作者。這些數據都顯示 BioRxiv越來越被認可。?
圖1.BioRxiv的累積投稿量、下載量及投稿作者數目。a)投稿量的整體趨勢。b) 總下載量的整體趨勢。c)每年向BioRxiv投稿的新增作者數及總作者數。
那么這些預印本手稿的發表情況如何呢?如果手稿已發表在雜志上,BioRxiv網站會在文章題目下方給出手稿發表雜志的鏈接,參照這一數據,迄今為止已有42%的文章被發表。其中進化生物學發表率最高,神經科學發表數目最多(圖2)。不過這一統計結果有個小問題,因為有些預印本在發表過程中改變了名稱,所以實際上這一數據更高,并且2017年以前上傳的預印本發表率基本上在60%以上, 2018年的發表率約為20%,拉低了平均水平,但也可以理解,畢竟2018年新上傳的手稿需要足夠時間發表。
?圖2. 不同專業領域預印本發表的比例(b)和數目(c)
另一個大家比較關注的問題是:預印本都去哪兒了?發表在什么雜志上了呢?數據顯示這些文章最終發表在1,531種不同雜志上,其中Scientific Reports 發表了最多(828),其次是elife(750)和PLOS ONE(741)(圖3)。雖然數目不多,還是有預印本發在高影響因子雜志上,如:至2018年11月,已有35篇文章發表在Cell上。那么這些文章的發表周期如何呢?作者統計了從預印本上傳日期和雜志發表日期的時間間隔,發現發表周期中位數是5.5個月,75%的雜志能在8個月內發表,90%的雜志能在一年內發表,而最長記錄是三年七個月。Nature Genetics的中位發表周期最長,約9個月;G3雜志最短,約4個月。
圖3.預印本的雜志發表情況:發表在Scientific Reports、elife、PLOS One雜志上的預印本數目最多
預印本的下載量可以表征該預印本的受關注程度。作者結合雜志影響因子和預印本下載量發現,高下載量的文章通常也發表在高影響因子雜志上,具有較高的正相關性(圖4)。發表在Nature Methods和Nature Genetics雜志上的預印本單篇下載量最高,而PLOS ONE上單篇下載量最低.
圖4.發表在不同雜志上的預印本的單篇文章下載量。中間框顯示雜志影響因子與其預印本中位下載量的關系。
怎么樣?是否也打算將你未發表的手稿先發布在bioRxiv預印本上呢?
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數據統計
數據評估
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