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原標題:南開&山大&北理工團隊開發trRosettaRNA:利用Transformer網絡自動預測RNA 3D結構
文章來源:機器之心
內容字數:6624字
內容摘要:將 ScienceAI設為星標第一時間掌握新鮮的 AI for Science 資訊編輯 | 蘿卜皮RNA 3D 結構預測是一個長期存在的挑戰。受最近蛋白質結構預測領域突破的啟發,南開大學、山東大學以及北京理工大學的研究團隊開發了 trRosettaRNA,這是一種基于深度學習的自動化 RNA 3D 結構預測方法。trRosettaRNA 流程包括兩個主要步驟:通過transformer網絡進行 1D 和 2D 幾何形狀預測;以及通過能量最小化進行的 3D 結構折疊?;鶞蕼y試表明 trRosettaRNA 優于傳統的自動化方法。在 CASP15 和 RNA-Puzzles 實驗的盲測中,對天然 RNA 的自動 trRosettaRNA 預測與人類的頂級預測具有競爭力。當通過均方根偏差的 Z 分數進行測量時,trRosettaRNA 的性能也優于 CASP15 中其他基于深度學習的方法。該研…
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