將合成生物學與AI相結合，以無細胞方式尋找新抗生素

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原標題：將合成生物學與AI相結合，以無細胞方式尋找新抗生素

關鍵字：報告,活性,深度,蛋白質,序列

文章來源：人工智能學家

內容字數：7510字

內容摘要：將 ScienceAI設為星標第一時間掌握新鮮的 AI for Science 資訊編輯 | 蘿卜皮生物活性肽是健康和醫學的關鍵分子。深度學習為生物活性肽的發現和設計帶來了巨大的希望。然而，需要合適的實驗方法來以高通量和低成本驗證候選物。馬克斯·普朗克陸地微生物研究所（Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology）的研究團隊建立了無細胞蛋白質合成（CFPS）管線，用于直接從 DNA 模板快速、廉價地生產抗菌肽 (AMP)。為了驗證該平臺，研究人員使用深度學習從頭設計了數千個 AMP。使用計算方法，研究人員對使用 CFPS 管線生成和篩選的 500 個候選物進行了優先排序。該團隊鑒定了 30 種功能性 AMP，并通過分子動力學模擬、抗菌活性和毒性對其進行了進一步表征。值得注意的是，六種 de novo-AMP 具有針對多重耐藥病原體的廣譜…

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