「超級細(xì)菌」魔咒或?qū)⒋蚱疲琈IT 利用深度學(xué)習(xí)發(fā)現(xiàn)新型抗生素
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原標(biāo)題:「超級細(xì)菌」魔咒或?qū)⒋蚱疲琈IT 利用深度學(xué)習(xí)發(fā)現(xiàn)新型抗生素
關(guān)鍵字:化合物,抗生素,活性,細(xì)胞,模型
文章來源:HyperAI超神經(jīng)
內(nèi)容字?jǐn)?shù):8944字
內(nèi)容摘要:
作者:加零
編輯:李寶珠、三羊
MIT 利用圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) Chemprop 識別潛在抗生素,特異性鮑曼不動桿菌。自然界中充滿了各種各樣的微生物,例如結(jié)核桿菌(導(dǎo)致肺結(jié)核)、霍亂弧菌(導(dǎo)致霍亂)等嚴(yán)重危害了人們的健康。而在人類歷史上,感染這些致病細(xì)菌,除了依賴人體自身的免疫系統(tǒng),幾乎無解。直到 1928 年,青霉素的發(fā)現(xiàn),讓人類第一次擁有了戰(zhàn)勝致病細(xì)菌的有力武器。
然而,抗生素的廣泛應(yīng)用也帶來了一個巨大的危機 —— 抗生素耐藥性 (AMR),據(jù)世界衛(wèi)生組織 (WHO) 統(tǒng)計, 2019 年全球約有 120 萬人死于抗生素耐藥性 (AMR) 所加劇的細(xì)菌感染,這已經(jīng)高于艾滋病導(dǎo)致的死亡人數(shù)。濫用抗生素催生某些「超級細(xì)菌」的出現(xiàn),成為了 21 世紀(jì)臨床重要致病因。要解決這一難題,迫切需要開發(fā)全新的抗生素。
針對特異細(xì)菌,深度學(xué)習(xí)模型可以提高對化合物藥效和安全性的預(yù)測準(zhǔn)確性,有效減少實驗室實驗和臨床試驗的時間和資源消耗,對有效且安全的抗生素發(fā)現(xiàn)至關(guān)重要。
為此,來自 MIT 的研究者們開發(fā)了一種深度學(xué)習(xí)方法來發(fā)現(xiàn)抗生素,利用圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) Chemprop 從大型化學(xué)庫中識別潛在的抗生素,并發(fā)現(xiàn)
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作者簡介:解構(gòu)技術(shù)先進(jìn)性與普適性,解讀更前沿的 AIForScience 案例