David Baker任科學(xué)顧問,初創(chuàng)公司發(fā)布世界最大蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù),已獲8輪融資
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原標(biāo)題:David Baker任科學(xué)顧問,初創(chuàng)公司發(fā)布世界最大蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù),已獲8輪融資
關(guān)鍵字:蛋白質(zhì),數(shù)據(jù),生物學(xué),抗體,定量
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作者:李姝
編輯:李寶珠
封面圖來源:A-Alpha Bio
生物技術(shù)初創(chuàng)公司 A-Alpha Bio 發(fā)布世界上最大的蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù) AlphaSeq,包含超 7.5 億條測(cè)量結(jié)果,并且每個(gè)月以 3M-50M 數(shù)據(jù)點(diǎn)的速度快速擴(kuò)展,解決數(shù)據(jù)集匱乏問題。蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用 (Protein-Protein Interactions, PPI) 是細(xì)胞生命活動(dòng)的重要組成部分,在調(diào)控和維持細(xì)胞的生理功能中(如細(xì)胞的信號(hào)傳導(dǎo)、代謝反應(yīng)和基因表達(dá))發(fā)揮著不可或缺的作用。
然而目前 PPl 數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)相對(duì)較少,最新的結(jié)合親和數(shù)據(jù)集 (PDBbind+) 只有 3,176 個(gè)數(shù)據(jù)。Dyno Therapeutics 的高級(jí)機(jī)器學(xué)習(xí)工程師 Abihishaike Mahajan 在其文章「Wet-lab innovations will lead the AI revolution in biology」中指出,AlphaFold 所取得的性進(jìn)展是極難復(fù)制的,最重要的原因是數(shù)據(jù),「我們幾乎用盡了所有預(yù)先存在的數(shù)據(jù),未經(jīng)訓(xùn)練的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和序列正在枯竭」。
他還介紹道,生物學(xué)領(lǐng)域高質(zhì)量
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