AlphaFold 3輕松應(yīng)對(duì)核酸、脂類分子?科學(xué)家迫不及待地更新了評(píng)測
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原標(biāo)題:AlphaFold 3輕松應(yīng)對(duì)核酸、脂類分子?科學(xué)家迫不及待地更新了評(píng)測
關(guān)鍵字:序列,回文,轉(zhuǎn)錄,限制性,結(jié)構(gòu)
文章來源:機(jī)器之心
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「如果這可以重現(xiàn)的話,這就是我們所知的世界末日!功能建模的新時(shí)代已經(jīng)開始。」歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(EMBL)的科學(xué)家 Jan Kosinski 發(fā)推文表示。他在 AlphaFold 3 發(fā)布后,立刻用它做了一系列簡單的測試,并把相關(guān)結(jié)果發(fā)在了 X 上。
「我取出了一個(gè)結(jié)構(gòu)未知的轉(zhuǎn)錄因子,將其折疊起來,將其識(shí)別序列嵌入更長的 DNA 中。AlphaFold 3 準(zhǔn)確定位了轉(zhuǎn)錄因子。」Kosinski 解釋道。
他使用的轉(zhuǎn)錄因子:https://jaspar2020.genereg.net/matrix/MA0027.2/
使用的 DNA 序列:CAGGATCCTAATTATGGATCCTGTGTATCTTCAGT
他用的模型是:https://oc.embl.de/index.php/s/SsDKcS06P1xewAV
他說:「一旦 AlphaFold 3 的開源副本可用并且運(yùn)行良好,我們也許能夠通過計(jì)算來預(yù)測所有轉(zhuǎn)錄因子的序列特異性。我認(rèn)為那會(huì)很大,對(duì)吧?」
同時(shí),嚴(yán)謹(jǐn)?shù)?Kosi
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