AlphaFold 3輕松應對核酸、脂類分子?科學家迫不及待地更新了評測
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原標題:AlphaFold 3輕松應對核酸、脂類分子?科學家迫不及待地更新了評測
關鍵字:序列,回文,轉錄,限制性,結構
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「如果這可以重現(xiàn)的話,這就是我們所知的世界末日!功能建模的新時代已經(jīng)開始。」歐洲分子生物學實驗室(EMBL)的科學家 Jan Kosinski 發(fā)推文表示。他在 AlphaFold 3 發(fā)布后,立刻用它做了一系列簡單的測試,并把相關結果發(fā)在了 X 上。
「我取出了一個結構未知的轉錄因子,將其折疊起來,將其識別序列嵌入更長的 DNA 中。AlphaFold 3 準確定位了轉錄因子。」Kosinski 解釋道。
他使用的轉錄因子:https://jaspar2020.genereg.net/matrix/MA0027.2/
使用的 DNA 序列:CAGGATCCTAATTATGGATCCTGTGTATCTTCAGT
他用的模型是:https://oc.embl.de/index.php/s/SsDKcS06P1xewAV
他說:「一旦 AlphaFold 3 的開源副本可用并且運行良好,我們也許能夠通過計算來預測所有轉錄因子的序列特異性。我認為那會很大,對吧?」
同時,嚴謹?shù)?Kosi
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