上海交大余祥課題組發(fā)布可遷移深度學(xué)習(xí)模型，鑒定多類型 RNA 修飾、顯著減少計(jì)算成本

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原標(biāo)題：上海交大余祥課題組發(fā)布可遷移深度學(xué)習(xí)模型，鑒定多類型 RNA 修飾、顯著減少計(jì)算成本
關(guān)鍵字：模型,轉(zhuǎn)錄,解讀,數(shù)據(jù),團(tuán)隊(duì)
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作者：哇塞
編輯：李寶珠，三羊
上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院長(zhǎng)聘教軌副教授余祥課題組，聯(lián)合上海辰山植物園楊俊 / 王紅霞團(tuán)隊(duì)，開(kāi)發(fā)了可遷移深度學(xué)習(xí)模型 TandemMod，實(shí)現(xiàn)了在 DRS 中鑒定多種類型的 RNA 修飾。2021 年，因中國(guó)科學(xué)院院士高福大聲疾呼，mRNA 疫苗一夜之間名聲鵲起，成為人們?cè)谛滦凸跔畈《舅僚捌陂g的希望。如今，那段特殊過(guò)往已成歷史，但 mRNA 疫苗背后的 RNA 修飾卻仍在以日新月異的速度向前發(fā)展。
所謂 RNA 修飾，是一類重要轉(zhuǎn)錄后調(diào)控方式，能夠廣泛參與各種 RNA 轉(zhuǎn)錄后的加工代謝途徑。
RNA 修飾之所以值得被關(guān)注，還因其在真核生物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮了至關(guān)重要的生物學(xué)功能。例如，近年研究發(fā)現(xiàn)，N?-腺苷 (m?A) 在哺乳動(dòng)物胚胎干細(xì)胞中的去穩(wěn)定化作用與多種疾病相關(guān)，5-胞嘧啶 (m?C) 與水稻對(duì)高溫的耐受性有關(guān)。
不過(guò)，RNA 具有多種類型的修飾，迄今為止，自然界 RNA 中被發(fā)現(xiàn)的修飾類型已超過(guò) 160 種。此前，由牛津納米孔科技有限公司 (Oxford Nanopore Technologies, ONT) 開(kāi)發(fā)的納米孔直接 RN

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