AlphaFold 3 向解碼分子行為和生物計(jì)算邁出重要一步,Nature 子刊銳評(píng)

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原標(biāo)題:AlphaFold 3 向解碼分子行為和生物計(jì)算邁出重要一步,Nature 子刊銳評(píng)
關(guān)鍵字:復(fù)合物,蛋白質(zhì),結(jié)構(gòu),分子,生物
文章來源:人工智能學(xué)家
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如果我們完全了解分子之間是如何相互作用的,那么生物學(xué)就沒什么可學(xué)的了,因?yàn)槊恳环N生物現(xiàn)象,包括我們?nèi)绾胃兄澜纾罱K都源于細(xì)胞內(nèi)生物分子的行為和相互作用。
最近推出的AlphaFold 3 可以直接從蛋白質(zhì)、核酸及其配體的序列中預(yù)測(cè)生物分子復(fù)合物的 3D 結(jié)構(gòu)。這標(biāo)志著我們?cè)陂L(zhǎng)期探索生物分子如何相互作用方面取得了重大進(jìn)展。
AlphaFold 3代表了直接從復(fù)合物序列預(yù)測(cè)其三維結(jié)構(gòu)的突破,為生物分子相互作用提供了見解。
生物分子(如蛋白質(zhì)或核酸)的一維 (1D) 序列以類似于一段代碼指定程序的方式指定細(xì)胞功能。該序列表示編程語言中的代碼,并通過折疊過程「編譯」成機(jī)器語言中的代碼,形成獨(dú)特的 3D 結(jié)構(gòu)。該程序由折疊的生物分子與細(xì)胞內(nèi)其他分子之間的相互作用執(zhí)行。
由于其獨(dú)特的三維結(jié)構(gòu),生物分子只會(huì)與細(xì)胞內(nèi)的一小部分分子(例如 DNA 位點(diǎn))相互作用,這些相互作用將引發(fā)一系列精心策劃的化學(xué)和結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化,共同定義生化程序(如轉(zhuǎn)錄)。生化過程的產(chǎn)物(如 RNA)代表執(zhí)行程序的輸出。
因此,在生物學(xué)中,生物分子的一維序列編碼了程序以及編譯和執(zhí)行程序的方法;該序
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