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原標題:GPT-4無師自通預測蛋白質結構登Nature子刊!LLM全面進軍生物學,AlphaFold被「偷家」?
關鍵字:報告,結構,建模,氨基酸,模型
文章來源:新智元
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新智元報道編輯:喬楊
【新智元導讀】距離GPT-4首次發布已經過去了將近一年半的時間,Nature最近發表的一篇報告卻探索出了這個「過氣」模型的新用途——氨基酸和蛋白質的結構建模。提到AI4Science, 尤其是AI在生物學領域的應用,DeepMind的AlphaFold已經成為了「出圈」的代表作,是生物學和計算交叉融合的里程碑。
2020年底,第一代AlphaFold就已經能以原子級別的精度預測蛋白質的三維形狀。然而,這僅僅是一個開始。
一個不那么明顯的事實是,與Meta FAIR研發的ESM系列不同,AlphaFold并非不是使用LLM構建的,而是依賴于一種名為「多序列比對」(MSA)的方法,是生物信息學領域一種較為傳統的做法。
當全球的目光聚焦于AlphaFold時,大語言模型在生物學領域的潛力或許被低估了。
去年,AI專欄作家、Radical VC合伙人Rob Toews在《福布斯》雜志上發表了一篇文章,預言LLM在生物領域的潛力。
相比速度慢且計算量大的MSA方法,LLM在規模化預測方面有更大的優勢,而且能產生同樣準確,甚至更準確的結構預測。
此外,語言模型能夠對蛋白質的
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