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原標題:Nature重磅研究:AlphaFold繪制病毒「族譜」,揭開身世之謎
關鍵字:病毒,蛋白質,模型,結構,蛋白
文章來源:新智元
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新智元報道編輯:喬楊 好困
【新智元導讀】除了蛋白質設計和藥物發現,Nature上最近刊登的一篇論文又解鎖了AlphaFold這類生物大模型的新用途——揭示生物的親緣關系和進化史。今年7月,被Meta解散的ESMFold團隊成功另起爐灶,發布了他們最新的生命科學大模型ESM3,打出的slogan正是「用語言模型模擬5億年進化?!?br />論文地址:https://evolutionaryscale-public.s3.us-east-2.amazonaws.com/research/esm3.pdf
這個用途,很快就被生物學家們敏銳地捕捉到了。
最近發表的很多工作中,科學家們正在用AlphaFold和ESMFold等模型,重新繪制病毒譜系,探索到了一些令人驚訝的「親緣關系」。
這些成果,不僅可以揭秘病毒家族的進化史,還能讓我們更好地應對未來的生化風險。
如果用傳統方法,科學家們需要根據基因組比較的結果來理解病毒進化。
但是和哺乳動物比起來,病毒的進化速度可以說是快如閃電,尤其是基因由RNA組成的病毒,需要比對的基因組數量和復雜度就會急遽增加。
此外,病毒的進化不僅來源于基因突變,它們還可以從
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