Nature重磅研究：AlphaFold繪制病毒「族譜」，揭開(kāi)身世之謎

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關(guān)鍵字：病毒,蛋白質(zhì),模型,結(jié)構(gòu),蛋白
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新智元報(bào)道編輯：?jiǎn)虠?好困
【新智元導(dǎo)讀】除了蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)和藥物發(fā)現(xiàn)，Nature上最近刊登的一篇論文又解鎖了AlphaFold這類生物大模型的新用途——揭示生物的親緣關(guān)系和進(jìn)化史。今年7月，被Meta解散的ESMFold團(tuán)隊(duì)成功另起爐灶，發(fā)布了他們最新的生命科學(xué)大模型ESM3，打出的slogan正是「用語(yǔ)言模型模擬5億年進(jìn)化。」
論文地址：https://evolutionaryscale-public.s3.us-east-2.amazonaws.com/research/esm3.pdf
這個(gè)用途，很快就被生物學(xué)家們敏銳地捕捉到了。
最近發(fā)表的很多工作中，科學(xué)家們正在用AlphaFold和ESMFold等模型，重新繪制病毒譜系，探索到了一些令人驚訝的「親緣關(guān)系」。
這些成果，不僅可以揭秘病毒家族的進(jìn)化史，還能讓我們更好地應(yīng)對(duì)未來(lái)的生化風(fēng)險(xiǎn)。
如果用傳統(tǒng)方法，科學(xué)家們需要根據(jù)基因組比較的結(jié)果來(lái)理解病毒進(jìn)化。
但是和哺乳動(dòng)物比起來(lái)，病毒的進(jìn)化速度可以說(shuō)是快如閃電，尤其是基因由RNA組成的病毒，需要比對(duì)的基因組數(shù)量和復(fù)雜度就會(huì)急遽增加。
此外，病毒的進(jìn)化不僅來(lái)源于基因突變，它們還可以從

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