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原標題:藥物分子設計新策略,微軟條件擴散模型DiffLinker登Nature子刊
關鍵字:片段,報告,分子,方法,原子
文章來源:機器之心
內容字數:5254字
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新鮮的 AI for Science 資訊編輯 | 紫羅
藥理學領域的化學空間高達 10^60,在廣闊的化學空間中進行搜索,給藥物設計帶來了巨大的挑戰。
基于片段的藥物發現一直是早期藥物開發的有效范例。然而,該領域面臨的一個挑戰是,如何設計斷開的感興趣分子片段之間的連接子(linker),生成化學上合理的候選藥物分子。
在此,來自微軟研究院科學智能中心(AI4Science)、洛桑聯邦理工學院、牛津大學和 MIT 的研究團隊,提出了一種用于分子 linker 設計的 E(3) 等變三維條件擴散模型 DiffLinker。
與以前只能連接分子片段對的方法不同,新方法可以連接任意數量的片段。此外,模型會自動確定 linker 中的原子數量及其與輸入片段的連接點。
DiffLinker 在標準數據集上優于其他方法,可生成更多樣化且可合成的分子。在實際應用中對其方法進行實驗測試,表明它可以成功生成以靶標蛋白口袋為條件的有效 linker。
研究人員表示,術語「linker」泛指任何能夠連接起始分子片段的化學物質,并不特指與所討論任一領域相關術語的特
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