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比最優(yōu)技術(shù)快 8 倍:浙大侯廷軍等人提出 ResGen,基于蛋白質(zhì)口袋的 3D 分子生成模型

比最優(yōu)技術(shù)快 8 倍:浙大侯廷軍等人提出 ResGen,基于蛋白質(zhì)口袋的 3D 分子生成模型

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原標題:比最優(yōu)技術(shù)快 8 倍:浙大侯廷軍等人提出 ResGen,基于蛋白質(zhì)口袋的 3D 分子生成模型
關(guān)鍵字:分子,蛋白質(zhì),模型,口袋,原子
文章來源:HyperAI超神經(jīng)
內(nèi)容字數(shù):8903字

內(nèi)容摘要:


作者:彬彬
編輯:李寶珠,三羊
浙江大學與之江實驗室研究團隊提出了一種基于蛋白質(zhì)口袋 (protein pocket) 的 3D 分子生成模型——ResGen,與以往最優(yōu)技術(shù)相比,速度提升 8 倍,成功地生成了具有更低結(jié)合能和更高多樣性的類藥物分子。過去,創(chuàng)新藥物的發(fā)現(xiàn)往往依賴于古早配方或?qū)嶒炛械呐既唬缜嗝顾亍6嗄陙恚肿由飳W和計算化學的進步,使藥物設計模式實現(xiàn)了從盲目篩選到合理設計的轉(zhuǎn)變。
盡管如此,藥物研發(fā)設計仍然是一個多環(huán)節(jié)流程,鏈路長且成本高昂,每一個環(huán)節(jié)的效率提高都有巨大價值。近年來,隨著 AI、大數(shù)據(jù)等技術(shù)的廣泛應用,AI 輔助藥物設計也在一次次的實驗中愈發(fā)成熟,AI 正在藥物研發(fā)的多個環(huán)節(jié)進行著提效增質(zhì)的升級改革。
其中,高質(zhì)量的分子生成模型可以有效提升先導化合物發(fā)現(xiàn)的效率。目前,大多分子生成工作都采用了基于配體的方法 (LBMG),然而該方法存在諸多局限性,例如無法考慮分子與靶標之間相互作用模式等。因此研究者們越來越關(guān)注基于結(jié)構(gòu)的分子生成 (SBMG,structure-based molecular generative) 的方法,即基于靶標結(jié)構(gòu)進行相應的分


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文章來源:HyperAI超神經(jīng)
作者微信:HyperAI
作者簡介:解構(gòu)技術(shù)先進性與普適性,解讀更前沿的 AIForScience 案例

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