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原標題:僅幾秒,準確推斷蛋白動力學信息,山大、北理工等AI模型RMSF-net登Nature子刊
關鍵字:動力學,蛋白質,電子顯微鏡,解讀,報告
文章來源:人工智能學家
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來源:ScienceAI
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蛋白質的動力學對于理解其機制至關重要。然而,通過計算預測蛋白質動學信息具有挑戰性。
在此,來自山東大學、百圖生科(BioMap)、北京理工大學、湖北醫藥學院、寧夏醫科大學和阿卜杜拉科技大學(KAUST)的研究團隊,提出了一個神經網絡模型 RMSF-net,其優于以前的方法,并在大規模蛋白質動力學數據集中產生最佳結果;該模型可以在幾秒鐘內準確推斷出蛋白質的動力學信息。
通過從實驗蛋白質結構數據和低溫電子顯微鏡 (cryo-EM) 數據集成中有效地學習,該方法能夠準確識別低溫電子顯微鏡圖和 PDB 模型之間的交互式雙向約束和監督,以最大限度地提高動力學預測效率。
RMSF-net 是一個可免費使用的工具,將在蛋白質動力學研究中發揮重要作用。
該研究以「Accurate Prediction of Protein Structural Flexibility by Deep Learning Integrating Intricate Atomic Structures and Cryo-EM Density Information」為題,于 7 月
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